百木园开源基金会对于开源软件和开源社区的组织、发展、协同创新提供了主导作用。开源基金会遵循公开、透明、开放等理念，为开源软件的孵化提供技术、运营、法律等全方位支持，为开源的社区建设和运营提供指导，发挥了孵化器和加速器的作用，开源基金会已成为开源生态最重要的组织者。
1985 年 —— 自由软件基金会成立
自由软件基金会（Free Software Foundation，简称 FSF）由 RMS 于 1985 年创立，这是一个非营利组织，其主要工作是运行 GNU 计划，使命是促进计算机用户的自由。基金会的员工编写并维护着一些 GNU 软件包。
1999 年 —— Apache 软件基金会成立
Apache 软件基金会（Apache Software Foundation，简称 ASF）正式创建于 1999 年，其前身是由一群开发爱好者构成的 \"Apache Group\"，他们通过 Brian Behlendorf 创建的邮件列表进行技术交流。
托管于 ASF 的项目均遵循 Apache License，ASF 对行业和开源的贡献除了开源项目，还包括开源治理方面的贡献，例如在 Apache 社区内外被广泛使用的 Apache License、主导社区协作管理的 Apache Way，以及通过非营利组织的身份来支持 Apache 项目及社区。
2000 年 —— Linux 基金会成立
Linux 基金会（Linux Foundation，简称 LF）成立于 2000 年。它通过提供开放源代码所需的统一资源和服务，与封闭平台能成功地竞争，从而促进、保护和标准化 Linux。LF 开始于 2000 年的开源码发展实验室 (OSDL)，并与自由标准组织 (FSG) 合并后从而成为现在的组织。
Linux 基金会赞助 Linux 创始人 Linus Torvalds 和主管维护者 Greg Kroah-Hartman 的工作。
2003 年 —— Mozilla 基金会成立
Mozilla 基金会 (Mozilla Foundation) 是为支持和领导开放源代码项目而设立的一个非营利组织。该组织制定管理开发政策，经营关键基础组织和管理商标及知识产权。它拥有一个子公司：Mozilla 公司，用来雇佣开发人员开发 Mozilla Firefox 浏览器和 Mozilla Thunderbird 电子邮件客户端。
Mozilla 基金会把自己描述为“一个致力于在互联网领域提供多样化选择和创新的公益组织”。在 Mozilla 基金会所遵循的 Mozilla 宣言当中，其中列出了十条原则，涵盖认为对全民及商业活动有益的互联网发展重要方针。
2004 年 —— Eclipse 基金会成立
Eclipse 基金会 (Eclipse Foundation) 成立于 2004 年，Eclipse 联盟（一个软件行业的联盟组织）发起成立了 Eclipse 基金会，由包括开发者、消费者和插件提供商在内的各独立团体组成董事会，为 Eclipse 的长期发展负责，并管理和领导 Eclipse 项目。
2006 年 —— Blender 基金会成立
Blender 基金会成立于 2006 年，这是一个为持续开发 Blender 而创建的非营利性组织。组织的创建是为了能雇佣 Blender 原始作者 Ton Roosendaal 全身心地投入到 Blender 的开发领导中，并维护整个软件的开发和分发工作积极有效。
Blender 基金会有一个广泛的目标：“让整个网络世界都能方便地使用三维技术，而且是以 Blender 作为这个目标的核心。”许多知名的互联网企业、软件厂商和游戏公司都加入了 Blender 基金会，例如育碧、微软、谷歌、亚马逊、Adobe、Facebook、NVIDIA 和 Epic 等公司。
2014 年 —— .NET 基金会成立
2014 年，.NET 基金会由微软公司成立与赞助，这是一个独立的自由软件组织，其宗旨在于推进与维护微软公司开放源代码后的 .NET 框架。
2015 年 —— 云原生计算基金会成立
2015 年，云原生计算基金会（Cloud Native Computing Foundation，简称 CNCF）成立，这是一个厂商中立的基金会，其最初的口号是坚持和整合开源技术来让编排容器作为微服务架构的一部分。
2015 年 —— RISC-V 基金会成立
RISC-V 基金会创建于 2015 年，旨在推广 RISC-V 开源指令集架构。2020 年 3 月基金会总部从美国迁往位于中立国瑞士的苏黎世。目前，RISC-V International 已经与 16 个来自不同国家和地区的行业组织建立了联盟，以确保跨越国家边界和利益纠纷的平等协作。
截至 2020 年，RISC-V 的技术社区已发展至 50 多个技术和特殊兴趣小组，开发者人数超过 2300 人。从嵌入式到企业的整个计算领域，基于 RISC-V 的 CPU 内核、SoC、开发板、软件和工具等在市场上都呈现明显的增长势头。基金会目前已有 900 多个成员，包括 215 个来自全球各地的组织机构。
2019 年 —— OpenJS 基金会成立
2019 年，JS 基金会和 Node.js 基金会合并成立 OpenJS 基金会，其使命是通过提供一个中立的组织来主导项目并共同赞助对整个生态有益的活动，进而促进 JavaScript 和 Web 生态的健康发展。
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